故事一开始便充满了奇异的事件和神秘的设定。上条当麻，一个被科学界认为是“无能力”的普通高中生，却在某天遇到了一个极其不寻常的事件。 一天，正当上条回家时，他看到自家阳台栏杆上挂着一位少女，姿态奇怪，仿佛像被单一样被挂在上面。这个情节让人感到荒诞而不真实，但接下来发生的一切却更加出乎意料。那位自称为“茵蒂克丝”的少女，向上条当麻透露，她拥有十万三千本魔导书，这些书籍蕴含着强大的魔法力量，因此她被魔法师追杀。 尽管在这座科技高度发达的学院都市里，超能力已经可以通过科学手段创造出来，但茵蒂克丝所展示出来的魔法力量，却让上条当麻震惊不已。这些超越科学的力量，证明了魔法与科技在这个世界中是并存的，而茵蒂克丝也因此卷入了一个充满危险的漩涡中。 出于对茵蒂克丝的关心，虽然上条自己并不具备强大的能力，但他还是让茵蒂克丝暂时住进了自己家。然而，事情的发展却让人始料未及。一天，上条放学回到家，发现茵蒂克丝倒在血泊中，显然受到了严重的伤害。这一事件让上条当麻开始意识到，他的普通生活将再也不会回到以前的平静。 此时，科学与魔法的世界开始交织在一起，危险的局势迫使上条当麻进入了一个全新的冒险中。他不仅要保护茵蒂克丝，避免她成为魔法世界和科学世界的牺牲品，还要面对来自魔法师、超能力者以及更大阴谋的威胁。 这个故事的开端，预示着上条当麻将展开一段充满冒险、挑战和情感波动的旅程。他在魔法与科学的交汇点上，必须不断努力和战斗，才能解决日益复杂的局势。而茵蒂克丝和他之间的关系，也在这个过程中逐渐发生变化，成为了故事的一个重要驱动力。